HELP     Sign In
Search

Relevance to Autism

A de novo loss-of-function (LoF) variant in the ZNF292 gene was identified in a female ASD proband with positive family history from the Autism Sequencing Consortium (Neale et al., 2012); a second de novo LoF variant in this gene was identified in an ASD proband from the Autism Clinical and Genetic Resources in China (ACGC) cohort (Wang et al., 2016).

Molecular Function

The protein encoded by this gene may be involved in transcriptional regulation.

External Links

        

References

Type
Title
Type of Disorder
Associated Disorders
Author, Year
Primary
Patterns and rates of exonic de novo mutations in autism spectrum disorders.
ASD
Support
Exome Pool-Seq in neurodevelopmental disorders.
DD
Support
Trio-based exome sequencing reveals a high rate of the de novo variants in intellectual disability
ADHD, ID
Support
De novo genic mutations among a Chinese autism spectrum disorder cohort.
ASD
Support
Mutational Landscape of Autism Spectrum Disorder Brain Tissue
ASD
Support
Analysis of recent shared ancestry in a familial cohort identifies coding and noncoding autism spectrum disorder variants
ASD
Support
Combining exome/genome sequencing with data repository analysis reveals novel gene-disease associations for a wide range of genetic disorders
ADHD, DD
Support
Large-scale targeted sequencing identifies risk genes for neurodevelopmental disorders
ASD, DD
ID
Support
ASD
OCD, ID
Support
Inherited and multiple de novo mutations in autism/developmental delay risk genes suggest a multifactorial model.
ASD
Support
Integrating de novo and inherited variants in 42
ASD
Recent Recommendation
De novo and inherited variants in ZNF292 underlie a neurodevelopmental disorder with features of autism spectrum disorder.
DD, ID, ASD
ADHD

Rare

Variant ID
Variant Type
Allele Change
Residue Change
Inheritance Pattern
Inheritance Association
Family Type
Author, Year
 GEN854R001 
 stop_gained 
 c.265C>T 
 p.Arg89Ter 
 De novo 
  
 Not simplex (positive family history) 
 GEN854R002 
 frameshift_variant 
 c.2490_2494dup 
 p.Ser832IlefsTer28 
 De novo 
  
  
 GEN854R003 
 frameshift_variant 
 c.3066_3069del 
 p.Ser1023GlnfsTer33 
 De novo 
  
  
 GEN854R004 
 frameshift_variant 
 c.4417dup 
 p.Ser1473PhefsTer5 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN854R005 
 missense_variant 
 c.5288A>G 
 p.Lys1763Arg 
 Familial 
 Maternal 
 Multiplex 
 GEN854R006 
 stop_gained 
 c.265C>T 
 p.Arg89Ter 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN854R007 
 frameshift_variant 
 c.433del 
 p.Ser145AlafsTer7 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN854R008 
 frameshift_variant 
 c.1160del 
 p.Arg387LeufsTer5 
 De novo 
  
 Multiplex 
 GEN854R009 
 stop_gained 
 c.1360C>T 
 p.Arg454Ter 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN854R010 
 stop_gained 
 c.1567C>T 
 p.Gln523Ter 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN854R011 
 frameshift_variant 
 c.2170del 
 p.Cys724AlafsTer9 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN854R012 
 frameshift_variant 
 c.2814_2821dup 
 p.Val941AlafsTer68 
 De novo 
  
  
 GEN854R013 
 frameshift_variant 
 c.3066_3069del 
 p.Glu1022AspfsTer3 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN854R014 
 frameshift_variant 
 c.3066_3069del 
 p.Glu1022AspfsTer3 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN854R015 
 frameshift_variant 
 c.3460_3463del 
 p.Val1154IlefsTer7 
 De novo 
  
 Multiplex 
 GEN854R016 
 frameshift_variant 
 c.3709dup 
 p.Thr1237AsnfsTer20 
 De novo 
  
  
 GEN854R017 
 frameshift_variant 
 c.3724del 
 p.Gln1242LysfsTer5 
 Familial 
 Maternal 
 Simplex 
 GEN854R018 
 stop_gained 
 c.3812C>A 
 p.Ser1271Ter 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN854R019 
 stop_gained 
 c.4897A>T 
 p.Lys1633Ter 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN854R020 
 stop_gained 
 c.5185C>T 
 p.Gln1729Ter 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN854R021 
 frameshift_variant 
 c.5515_5569del 
 p.Glu1839HisfsTer6 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN854R022 
 frameshift_variant 
 c.5959_5965dup 
 p.Gly1989AlafsTer9 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN854R023 
 frameshift_variant 
 c.6142_6145del 
 p.Lys2048ValfsTer11 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN854R024 
 frameshift_variant 
 c.6160_6161del 
 p.Glu2054LysfsTer14 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN854R025 
 frameshift_variant 
 c.6160_6161del 
 p.Glu2054LysfsTer14 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN854R026 
 frameshift_variant 
 c.6160_6161del 
 p.Glu2054LysfsTer14 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN854R027 
 frameshift_variant 
 c.6160_6161del 
 p.Glu2054LysfsTer14 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN854R028 
 frameshift_variant 
 c.6279dup 
 p.Arg2094ThrfsTer10 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN854R029 
 stop_gained 
 c.6343C>T 
 p.Arg2115Ter 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN854R030 
 stop_gained 
 c.6541C>T 
 p.Arg2181Ter 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN854R031 
 frameshift_variant 
 c.6661_6664del 
 p.Leu2221SerfsTer10 
 De novo 
  
  
 GEN854R032 
 stop_gained 
 c.1567C>T 
 p.Gln523Ter 
 De novo 
  
  
 GEN854R033 
 missense_variant 
 c.7220A>G 
 p.Tyr2407Cys 
 De novo 
  
  
 GEN854R034 
 frameshift_variant 
 c.7016del 
 p.Asn2339IlefsTer3 
 Unknown 
  
  
 GEN854R035 
 frameshift_variant 
 c.7016del 
 p.Asn2339IlefsTer3 
 Unknown 
  
  
 GEN854R036 
 frameshift_variant 
 c.6279dup 
 p.Arg2094ThrfsTer10 
 Unknown 
  
  
 GEN854R037 
 stop_gained 
 c.1897C>T 
 p.Arg633Ter 
 Unknown 
  
  
 GEN854R038 
 stop_gained 
 c.6823C>T 
 p.Arg2275Ter 
 Unknown 
  
  
 GEN854R039 
 stop_gained 
 c.7261C>T 
 p.Arg2421Ter 
 Unknown 
  
  
 GEN854R040 
 frameshift_variant 
 c.1625_1628dup 
 p.Tyr543Ter 
 Unknown 
  
  
 GEN854R041 
 stop_gained 
 c.4315C>T 
 p.Gln1439Ter 
 Unknown 
  
  
 GEN854R042 
 frameshift_variant 
 c.5740_5741del 
 p.Glu1914LysfsTer14 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN854R043 
 frameshift_variant 
 c.5672del 
 p.Asn1891IlefsTer6 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN854R044 
 stop_gained 
 c.1360C>T 
 p.Arg454Ter 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN854R045 
 missense_variant 
 c.6542G>T 
 p.Arg2181Leu 
 Unknown 
  
  
 GEN854R046 
 frameshift_variant 
 c.6160_6161del 
 p.Glu2054LysfsTer14 
 De novo 
  
  
 GEN854R047 
 synonymous_variant 
 c.4353A>G 
 p.Pro1451%3D 
 De novo 
  
  
 GEN854R048 
 missense_variant 
 c.2621C>T 
 p.Ser874Leu 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN854R049 
 frameshift_variant 
 c.5331dup 
 p.Gln1778SerfsTer5 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN854R050 
 synonymous_variant 
 c.5460A>G 
 p.Pro1820%3D 
 De novo 
  
  
 GEN854R051a 
 missense_variant 
 c.3437A>G 
 p.Asn1146Ser 
 Unknown 
  
 Multiplex 
  et al.  
 GEN854R051b 
 missense_variant 
 c.8132A>G 
 p.Asp2711Gly 
 Unknown 
  
 Multiplex 
  et al.  

Common

No Common Variants Available
Chromosome
CNV Locus
CNV Type
# of studies
Animal Model
6
Deletion
 1
 
6
Deletion
 1
 
6
Deletion
 1
 
6
Deletion
 2
 
6
Deletion
 3
 
6
Deletion
 1
 
6
Deletion
 1
 
6
Deletion
 1
 
6
Deletion-Duplication
 16
 

No Animal Model Data Available

 

No Interactions Available
HELP
Copyright © 2017 MindSpec, Inc.