HELP     Sign In
Search

Relevance to Autism

Mutations in the NAA10 gene are responsible for Ogden syndrome (OMIM 300855), an X-linked neurodevelopmental disorder characterized by postnatal growth failure, severely delayed psychomotor development, variable dysmorphic features, and hypotonia; a subset of individuals with this syndrome have also presented with autism spectrum disorder or autistic features/stereotypy (Popp et al., 2015; Saunier et al., 2016; Sidhu et al., 2017; Valentine et al., 2018; Cheng et al., 2019; Bader et al., 2020; Maini et al., 2021; McTiernan et al., 2022; Lyon et al., 2023). Mutations in this gene are also responsible for a syndromic form of microphthalmia (MCOPS1; OMIM 309800), an X-linked disorder characterized by unilateral or bilateral microphthalmia or anophthalmia with frequently observed extraocular features that include impaired intellectual development, large and dysplastic ears with skin tags, high-arched or cleft palate, dental anomalies, urogenital anomalies, and skeletal manifestations including lordosis or scoliosis, clinodactyly, syndactyly, brachydactyly, and abnormal thumbs; worsening autistic behavior was observed in one of three brothers with this condition who had a maternally-inherited splice-site variant in the NAA10 gene (Esmailpour et al., 2014). Missense variants in the NAA10 gene have also been identified in ASD probands from WES/WGS studies (Mahjani et al., 2021; Chan et al., 2022).

Molecular Function

N-alpha-acetylation is among the most common post-translational protein modifications in eukaryotic cells. This process involves the transfer of an acetyl group from acetyl-coenzyme A to the alpha-amino group on a nascent polypeptide and is essential for normal cell function. This gene encodes an N-terminal acetyltransferase that functions as the catalytic subunit of the major amino-terminal acetyltransferase A complex.

External Links

        

References

Type
Title
Type of Disorder
Associated Disorders
Author, Year
Primary
DD, ID
ASD, ADHD, epilepsy/seizures, stereotypy
Support
Ogden syndrome, ASD, DD, epilepsy/seizures
Support
Ogden syndrome, DD, ID
Autistic features
Support
Ogden syndrome, DD, ID
ADHD, epilepsy/seizures, stereotypy
Support
Prevalence and phenotypic impact of rare potentially damaging variants in autism spectrum disorder
ASD
Support
Ogden syndrome, DD, ID, epilepsy/seizures
Support
Ogden syndrome, DD, ID, epilepsy/seizures
Stereotypy
Support
DD, ID
Autistic features, stereotypy
Support
Ogden syndrome, DD, ID
Stereotypy
Support
Syndromic microphthalmia-1, DD, ID
Autistic behavior, epilepsy/seizures
Support
Phenotypic and biochemical analysis of an international cohort of individuals with variants in NAA10 and NAA15.
Ogden syndrome, DD, ID
ASD or autistic features, ADHD, epilepsy/seizures,
Support
Functional evaluation of NAA10 variants in patients with Ogden syndrome
Ogden syndrome, ASD
ADHD, ID, epilepsy/seizures
Support
Ogden syndrome, DD, epilepsy/seizures
Stereotypy
Support
Genome-wide rare variant score associates with morphological subtypes of autism spectrum disorder
ASD

Rare

Variant ID
Variant Type
Allele Change
Residue Change
Inheritance Pattern
Inheritance Association
Family Type
Author, Year
 GEN1397R001 
 missense_variant 
 c.29A>G 
 p.Asp10Gly 
 De novo 
  
  
 GEN1397R002 
 missense_variant 
 c.32T>G 
 p.Leu11Arg 
 Unknown 
 Not maternal 
  
 GEN1397R003 
 missense_variant 
 c.215T>C 
 p.Ile72Thr 
 Familial 
 Maternal 
  
 GEN1397R004 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R005 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R006 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R007 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R008 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R009 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R010 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R011 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R012 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R013 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R014 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R015 
 missense_variant 
 c.259G>T 
 p.Ala87Ser 
 De novo 
  
  
 GEN1397R016 
 missense_variant 
 c.259G>T 
 p.Ala87Ser 
 De novo 
  
  
 GEN1397R017 
 missense_variant 
 c.259G>T 
 p.Ala87Ser 
 De novo 
  
  
 GEN1397R018 
 missense_variant 
 c.311C>A 
 p.Ala104Asp 
 De novo 
  
  
 GEN1397R019 
 missense_variant 
 c.361C>G 
 p.Leu121Val 
 De novo 
  
  
 GEN1397R020 
 missense_variant 
 c.361C>G 
 p.Leu121Val 
 Unknown 
  
  
 GEN1397R021 
 missense_variant 
 c.384T>G 
 p.Phe128Leu 
 De novo 
  
  
 GEN1397R022 
 missense_variant 
 c.440T>C 
 p.Met147Thr 
 De novo 
  
  
 GEN1397R023 
 frameshift_variant 
 c.410_413del 
 p.Thr137ArgfsTer6 
 Familial 
 Maternal 
 Simplex 
 GEN1397R024 
 splice_site_variant 
 c.426+2T>A 
  
 Familial 
 Maternal 
 Multiplex 
 GEN1397R025 
 missense_variant 
 c.319G>T 
 p.Val107Phe 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN1397R026 
 missense_variant 
 c.346C>T 
 p.Arg116Trp 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN1397R027 
 missense_variant 
 c.346C>T 
 p.Arg116Trp 
 De novo 
  
  
 GEN1397R028 
 missense_variant 
 c.384T>A 
 p.Phe128Leu 
 De novo 
  
  
 GEN1397R029 
 missense_variant 
 c.384T>A 
 p.Phe128Leu 
 De novo 
  
  
 GEN1397R030 
 missense_variant 
 c.382T>A 
 p.Phe128Ile 
 De novo 
  
  
 GEN1397R031 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R032 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R033 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R034 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R035 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R036 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R037 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo (germline mosaicism) 
  
 Multiplex 
 GEN1397R038 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R039 
 missense_variant 
 c.346C>T 
 p.Arg116Trp 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN1397R040 
 missense_variant 
 c.47A>C 
 p.His16Pro 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN1397R041 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN1397R042 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 Unknown 
  
  
 GEN1397R043 
 missense_variant 
 c.16G>C 
 p.Ala6Pro 
 Familial 
 Maternal 
 Simplex 
 GEN1397R044 
 missense_variant 
 c.235C>T 
 p.Arg79Cys 
 Familial 
 Maternal 
 Extended multiplex 
 GEN1397R045 
 missense_variant 
 c.384T>G 
 p.Phe128Leu 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN1397R046 
 missense_variant 
 c.386A>C 
 p.Gln129Pro 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN1397R047 
 missense_variant 
 c.469G>A 
 p.Glu157Lys 
 Familial 
 Maternal 
 Simplex 
 GEN1397R048 
 missense_variant 
 c.346C>G 
 p.Arg116Gly 
 De novo 
  
  
 GEN1397R049a 
 missense_variant 
 c.22C>T 
 p.Pro8Ser 
 De novo 
  
  
 GEN1397R049b 
 missense_variant 
 c.30C>G 
 p.Asp10Glu 
 De novo 
  
  
 GEN1397R050 
 missense_variant 
 c.47A>C 
 p.His16Pro 
 De novo 
  
  
 GEN1397R051 
 missense_variant 
 c.92A>G 
 p.Tyr31Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R052 
 missense_variant 
 c.215T>C 
 p.Ile72Thr 
 Familial 
 Maternal 
  
 GEN1397R053 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R054 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R055 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R056 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R057 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R058 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R059 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R060 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R061 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R062 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R063 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R064 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R065 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R066 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R067 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R068 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R069 
 missense_variant 
 c.359A>C 
 p.His120Pro 
 De novo 
  
  
 GEN1397R070 
 missense_variant 
 c.367T>C 
 p.Ser123Pro 
 De novo 
  
  
 GEN1397R071 
 missense_variant 
 c.383T>C 
 p.Phe128Ser 
 De novo 
  
  
 GEN1397R072 
 missense_variant 
 c.384T>G 
 p.Phe128Leu 
 De novo 
  
  
 GEN1397R073 
 missense_variant 
 c.384T>G 
 p.Phe128Leu 
 De novo 
  
  
 GEN1397R074 
 missense_variant 
 c.384T>G 
 p.Phe128Leu 
 De novo 
  
  
 GEN1397R075 
 missense_variant 
 c.384T>G 
 p.Phe128Leu 
 De novo 
  
  
 GEN1397R076 
 missense_variant 
 c.384T>G 
 p.Phe128Leu 
 De novo 
  
  
 GEN1397R077 
 missense_variant 
 c.440T>C 
 p.Met147Thr 
 De novo 
  
  
 GEN1397R078 
 missense_variant 
 c.440T>C 
 p.Met147Thr 
 De novo 
  
  
 GEN1397R079 
 missense_variant 
 c.445C>T 
 p.Arg149Trp 
 De novo 
  
  
 GEN1397R080 
 frameshift_variant 
 c.455_458del 
 p.Thr152ArgfsTer6 
 Familial 
 Maternal 
  
 GEN1397R081 
 frameshift_variant 
 c.499_500del 
 p.Ser167GlnfsTer23 
 Familial 
 Maternal 
  
 GEN1397R082 
 missense_variant 
 c.128A>C 
 p.Tyr43Ser 
 Familial 
 Maternal 
 Multiplex 
 GEN1397R083 
 missense_variant 
 c.346C>T 
 p.Arg116Trp 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN1397R084 
 missense_variant 
 c.439A>T 
 p.Met147Leu 
 De novo 
  
 Simplex 

Common

No Common Variants Available
Chromosome
CNV Locus
CNV Type
# of studies
Animal Model
X
Deletion
 1
 
X
Duplication
 1
 
X
Deletion-Duplication
 22
 
X
Deletion
 2
 
X
Deletion
 1
 
X
Deletion
 2
 
X
Deletion-Duplication
 1
 
X
Deletion
 2
 
X
Deletion-Duplication
 1
 
X
Deletion
 12
 
X
Deletion-Duplication
 83
 

No Animal Model Data Available

 

No Interactions Available
HELP
Copyright © 2017 MindSpec, Inc.