HELP     Sign In
Search

Relevance to Autism

Mutations in the NAA10 gene are responsible for Ogden syndrome (OMIM 300855), an X-linked neurodevelopmental disorder characterized by postnatal growth failure, severely delayed psychomotor development, variable dysmorphic features, and hypotonia; a subset of individuals with this syndrome have also presented with autism spectrum disorder or autistic features/stereotypy (Popp et al., 2015; Saunier et al., 2016; Sidhu et al., 2017; Valentine et al., 2018; Cheng et al., 2019; Bader et al., 2020; Maini et al., 2021; McTiernan et al., 2022; Lyon et al., 2023). Mutations in this gene are also responsible for a syndromic form of microphthalmia (MCOPS1; OMIM 309800), an X-linked disorder characterized by unilateral or bilateral microphthalmia or anophthalmia with frequently observed extraocular features that include impaired intellectual development, large and dysplastic ears with skin tags, high-arched or cleft palate, dental anomalies, urogenital anomalies, and skeletal manifestations including lordosis or scoliosis, clinodactyly, syndactyly, brachydactyly, and abnormal thumbs; worsening autistic behavior was observed in one of three brothers with this condition who had a maternally-inherited splice-site variant in the NAA10 gene (Esmailpour et al., 2014). Missense variants in the NAA10 gene have also been identified in ASD probands from WES/WGS studies (Mahjani et al., 2021; Chan et al., 2022).

Molecular Function

N-alpha-acetylation is among the most common post-translational protein modifications in eukaryotic cells. This process involves the transfer of an acetyl group from acetyl-coenzyme A to the alpha-amino group on a nascent polypeptide and is essential for normal cell function. This gene encodes an N-terminal acetyltransferase that functions as the catalytic subunit of the major amino-terminal acetyltransferase A complex.

External Links

        

References

Type
Title
Type of Disorder
Associated Disorders
Author, Year
Primary
DD, ID
ASD, ADHD, epilepsy/seizures, stereotypy
Support
Ogden syndrome, DD, ID
ADHD, epilepsy/seizures, stereotypy
Support
Prevalence and phenotypic impact of rare potentially damaging variants in autism spectrum disorder
ASD
Support
Ogden syndrome, DD, ID, epilepsy/seizures
Support
Ogden syndrome, DD, ID, epilepsy/seizures
Stereotypy
Support
DD, ID
Autistic features, stereotypy
Support
Ogden syndrome, DD, ID
Stereotypy
Support
Syndromic microphthalmia-1, DD, ID
Autistic behavior, epilepsy/seizures
Support
Phenotypic and biochemical analysis of an international cohort of individuals with variants in NAA10 and NAA15.
Ogden syndrome, DD, ID
ASD or autistic features, ADHD, epilepsy/seizures,
Support
Ogden syndrome, DD, epilepsy/seizures
Stereotypy
Support
Genome-wide rare variant score associates with morphological subtypes of autism spectrum disorder
ASD
Support
Ogden syndrome, ASD, DD, epilepsy/seizures
Support
Ogden syndrome, DD, ID
Autistic features

Rare

Variant ID
Variant Type
Allele Change
Residue Change
Inheritance Pattern
Inheritance Association
Family Type
Author, Year
 GEN1397R001 
 missense_variant 
 c.29A>G 
 p.Asp10Gly 
 De novo 
  
  
 GEN1397R002 
 missense_variant 
 c.32T>G 
 p.Leu11Arg 
 Unknown 
 Not maternal 
  
 GEN1397R003 
 missense_variant 
 c.215T>C 
 p.Ile72Thr 
 Familial 
 Maternal 
  
 GEN1397R004 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R005 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R006 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R007 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R008 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R009 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R010 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R011 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R012 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R013 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R014 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R015 
 missense_variant 
 c.259G>T 
 p.Ala87Ser 
 De novo 
  
  
 GEN1397R016 
 missense_variant 
 c.259G>T 
 p.Ala87Ser 
 De novo 
  
  
 GEN1397R017 
 missense_variant 
 c.259G>T 
 p.Ala87Ser 
 De novo 
  
  
 GEN1397R018 
 missense_variant 
 c.311C>A 
 p.Ala104Asp 
 De novo 
  
  
 GEN1397R019 
 missense_variant 
 c.361C>G 
 p.Leu121Val 
 De novo 
  
  
 GEN1397R020 
 missense_variant 
 c.361C>G 
 p.Leu121Val 
 Unknown 
  
  
 GEN1397R021 
 missense_variant 
 c.384T>G 
 p.Phe128Leu 
 De novo 
  
  
 GEN1397R022 
 missense_variant 
 c.440T>C 
 p.Met147Thr 
 De novo 
  
  
 GEN1397R023 
 frameshift_variant 
 c.410_413del 
 p.Thr137ArgfsTer6 
 Familial 
 Maternal 
 Simplex 
 GEN1397R024 
 splice_site_variant 
 c.426+2T>A 
  
 Familial 
 Maternal 
 Multiplex 
 GEN1397R025 
 missense_variant 
 c.319G>T 
 p.Val107Phe 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN1397R026 
 missense_variant 
 c.346C>T 
 p.Arg116Trp 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN1397R027 
 missense_variant 
 c.346C>T 
 p.Arg116Trp 
 De novo 
  
  
 GEN1397R028 
 missense_variant 
 c.384T>A 
 p.Phe128Leu 
 De novo 
  
  
 GEN1397R029 
 missense_variant 
 c.384T>A 
 p.Phe128Leu 
 De novo 
  
  
 GEN1397R030 
 missense_variant 
 c.382T>A 
 p.Phe128Ile 
 De novo 
  
  
 GEN1397R031 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R032 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R033 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R034 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R035 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R036 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R037 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo (germline mosaicism) 
  
 Multiplex 
 GEN1397R038 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R039 
 missense_variant 
 c.346C>T 
 p.Arg116Trp 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN1397R040 
 missense_variant 
 c.47A>C 
 p.His16Pro 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN1397R041 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN1397R042 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 Unknown 
  
  
 GEN1397R043 
 missense_variant 
 c.16G>C 
 p.Ala6Pro 
 Familial 
 Maternal 
 Simplex 
 GEN1397R044 
 missense_variant 
 c.235C>T 
 p.Arg79Cys 
 Familial 
 Maternal 
 Extended multiplex 
 GEN1397R045 
 missense_variant 
 c.384T>G 
 p.Phe128Leu 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN1397R046 
 missense_variant 
 c.386A>C 
 p.Gln129Pro 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN1397R047 
 missense_variant 
 c.469G>A 
 p.Glu157Lys 
 Familial 
 Maternal 
 Simplex 
 GEN1397R048 
 missense_variant 
 c.346C>G 
 p.Arg116Gly 
 De novo 
  
  
 GEN1397R049a 
 missense_variant 
 c.22C>T 
 p.Pro8Ser 
 De novo 
  
  
 GEN1397R049b 
 missense_variant 
 c.30C>G 
 p.Asp10Glu 
 De novo 
  
  
 GEN1397R050 
 missense_variant 
 c.47A>C 
 p.His16Pro 
 De novo 
  
  
 GEN1397R051 
 missense_variant 
 c.92A>G 
 p.Tyr31Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R052 
 missense_variant 
 c.215T>C 
 p.Ile72Thr 
 Familial 
 Maternal 
  
 GEN1397R053 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R054 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R055 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R056 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R057 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R058 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R059 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R060 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R061 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R062 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R063 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R064 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R065 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R066 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R067 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R068 
 missense_variant 
 c.247C>T 
 p.Arg83Cys 
 De novo 
  
  
 GEN1397R069 
 missense_variant 
 c.359A>C 
 p.His120Pro 
 De novo 
  
  
 GEN1397R070 
 missense_variant 
 c.367T>C 
 p.Ser123Pro 
 De novo 
  
  
 GEN1397R071 
 missense_variant 
 c.383T>C 
 p.Phe128Ser 
 De novo 
  
  
 GEN1397R072 
 missense_variant 
 c.384T>G 
 p.Phe128Leu 
 De novo 
  
  
 GEN1397R073 
 missense_variant 
 c.384T>G 
 p.Phe128Leu 
 De novo 
  
  
 GEN1397R074 
 missense_variant 
 c.384T>G 
 p.Phe128Leu 
 De novo 
  
  
 GEN1397R075 
 missense_variant 
 c.384T>G 
 p.Phe128Leu 
 De novo 
  
  
 GEN1397R076 
 missense_variant 
 c.384T>G 
 p.Phe128Leu 
 De novo 
  
  
 GEN1397R077 
 missense_variant 
 c.440T>C 
 p.Met147Thr 
 De novo 
  
  
 GEN1397R078 
 missense_variant 
 c.440T>C 
 p.Met147Thr 
 De novo 
  
  
 GEN1397R079 
 missense_variant 
 c.445C>T 
 p.Arg149Trp 
 De novo 
  
  
 GEN1397R080 
 frameshift_variant 
 c.455_458del 
 p.Thr152ArgfsTer6 
 Familial 
 Maternal 
  
 GEN1397R081 
 frameshift_variant 
 c.499_500del 
 p.Ser167GlnfsTer23 
 Familial 
 Maternal 
  
 GEN1397R082 
 missense_variant 
 c.128A>C 
 p.Tyr43Ser 
 Familial 
 Maternal 
 Multiplex 

Common

No Common Variants Available
Chromosome
CNV Locus
CNV Type
# of studies
Animal Model
X
Deletion
 1
 
X
Duplication
 1
 
X
Deletion-Duplication
 21
 
X
Deletion
 2
 
X
Deletion
 1
 
X
Deletion
 1
 
X
Deletion-Duplication
 1
 
X
Deletion
 2
 
X
Deletion-Duplication
 1
 
X
Deletion
 10
 
X
Deletion-Duplication
 78
 

No Animal Model Data Available

 

No Interactions Available
HELP
Copyright © 2017 MindSpec, Inc.