HELP     Sign In
Search

Relevance to Autism

Multiple de novo variants in the MSL2 gene, including two de novo loss-of-function variants and several de novo missense variants, have been identified in ASD probands (Iossifov et al., 2014; Zhou et al., 2022; Trost et al., 2022; Costa et al., 2023). Two de novo loss-of-function variants in this gene were also identified in Chinese NDD probands (Zhang et al., 2021).

Molecular Function

Predicted to enable ubiquitin protein ligase activity. Involved in histone H4-K16 acetylation. Part of MSL complex.

External Links

        

References

Type
Title
Type of Disorder
Associated Disorders
Author, Year
Support
Novel protein-truncating variants of a chromatin-modifying gene MSL2 in syndromic neurodevelopmental disorders
DD
ASD, ID, epilepsy/seizures
Support
Genomic architecture of autism from comprehensive whole-genome sequence annotation
ASD
Support
Integrating de novo and inherited variants in 42
ASD
Support
The contribution of de novo coding mutations to autism spectrum disorder
ASD
Recent Recommendation
MSL2 variants lead to a neurodevelopmental syndrome with lack of coordination, epilepsy, specific dysmorphisms, and a distinct episignature
DD, ID
ASD or autistic features, ADD/ADHD, epilepsy/seizu

Rare

Variant ID
Variant Type
Allele Change
Residue Change
Inheritance Pattern
Inheritance Association
Family Type
Author, Year
 GEN1404R001 
 frameshift_variant 
 c.694_697del 
 p.Ser232ThrfsTer10 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN1404R002 
 missense_variant 
 c.1394G>T 
 p.Gly465Val 
 De novo 
  
  
 GEN1404R003 
 synonymous_variant 
 c.999G>A 
 p.Pro333= 
 De novo 
  
  
 GEN1404R004 
 frameshift_variant 
 c.848_849del 
 p.Thr283ArgfsTer6 
 De novo 
  
  
 GEN1404R005 
 missense_variant 
 c.1642G>C 
 p.Val548Leu 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN1404R006 
 missense_variant 
 c.1625G>T 
 p.Ser542Ile 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN1404R007 
 frameshift_variant 
 c.1457del 
 p.Ser486IlefsTer12 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN1404R008 
 frameshift_variant 
 c.796_797del 
 p.Leu266ValfsTer5 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN1404R009 
 initiator_codon_variant 
 c.1A>G 
 p.Met1? 
 Familial 
 Maternal 
 Simplex 
 GEN1404R010 
 frameshift_variant 
 c.574_575del 
 p.Leu192ValfsTer5 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN1404R011 
 frameshift_variant 
 c.1047_1050del 
 p.Ser349ArgfsTer23 
 Unknown 
 Not maternal 
 Simplex 
 GEN1404R012 
 stop_gained 
 c.67G>T 
 p.Gly23Ter 
 Unknown 
  
 Multi-generational 
 GEN1404R013 
 initiator_codon_variant 
 c.1A>G 
 p.Met1? 
 Unknown 
  
  
 GEN1404R014 
 missense_variant 
 c.44G>T 
 p.Arg15Leu 
 De novo 
  
  
 GEN1404R015 
 missense_variant 
 c.949A>G 
 p.Met317Val 
 De novo 
  
  
 GEN1404R016 
 stop_gained 
 c.511C>T 
 p.Gln171Ter 
 De novo 
  
  
 GEN1404R017 
 stop_gained 
 c.312dup 
 p.Glu105Ter 
 De novo 
  
  
 GEN1404R018 
 stop_gained 
 c.556del 
 p.Ile186Ter 
 De novo 
  
  
 GEN1404R019 
 stop_gained 
 c.1057C>T 
 p.Gln353Ter 
 De novo 
  
  
 GEN1404R020 
 stop_gained 
 c.1231_1232del 
 p.His412Ter 
 De novo 
  
  
 GEN1404R021 
 frameshift_variant 
 c.105dup 
 p.Pro36AlafsTer36 
 De novo 
  
  
 GEN1404R022 
 frameshift_variant 
 c.112_115dup 
 p.Arg39LeufsTer34 
 De novo 
  
  
 GEN1404R023 
 frameshift_variant 
 c.174_177del 
 p.Leu59MetfsTer22 
 De novo 
  
  
 GEN1404R024 
 frameshift_variant 
 c.299dup 
 p.Leu100PhefsTer6 
 De novo 
  
  
 GEN1404R025 
 frameshift_variant 
 c.659dup 
 p.Cys221MetfsTer2 
 De novo 
  
  
 GEN1404R026 
 frameshift_variant 
 c.684_685del 
 p.Glu229GlyfsTer4 
 Familial 
 Maternal 
 Multiplex 
 GEN1404R027 
 frameshift_variant 
 c.472_475del 
 p.Ser158ThrfsTer10 
 De novo 
  
  
 GEN1404R028 
 frameshift_variant 
 c.472_475del 
 p.Ser158ThrfsTer10 
 De novo 
  
  
 GEN1404R029 
 frameshift_variant 
 c.472_475del 
 p.Ser158ThrfsTer10 
 De novo 
  
  
 GEN1404R030 
 frameshift_variant 
 c.472_475del 
 p.Ser158ThrfsTer10 
 De novo 
  
  
 GEN1404R031 
 frameshift_variant 
 c.482_485dup 
 p.Pro163AlafsTer5 
 De novo 
  
  
 GEN1404R032 
 frameshift_variant 
 c.545del 
 p.Phe182SerfsTer5 
 De novo 
  
  
 GEN1404R033 
 frameshift_variant 
 c.574_575del 
 p.Leu192ValfsTer5 
 De novo 
  
  
 GEN1404R034 
 frameshift_variant 
 c.574_575del 
 p.Leu192ValfsTer5 
 De novo 
  
  
 GEN1404R035 
 frameshift_variant 
 c.823del 
 p.Arg275AlafsTer3 
 De novo 
  
  
 GEN1404R036 
 frameshift_variant 
 c.880del 
 p.Ala294HisfsTer5 
 De novo 
  
  
 GEN1404R037 
 frameshift_variant 
 c.733_737del 
 p.Asp245MetfsTer6 
 De novo 
  
  

Common

No Common Variants Available
Chromosome
CNV Locus
CNV Type
# of studies
Animal Model
3
Deletion
 1
 
3
Deletion
 1
 
3
Duplication
 4
 
3
Deletion
 1
 

No Animal Model Data Available

 

No Interactions Available
HELP
Copyright © 2017 MindSpec, Inc.