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Relevance to Autism

Rare inherited loss-of-function and damaging missense variants in the KRT26 gene were identified in ASD probands from the Simons Simplex Collection (Krumm et al., 2015) and in a cohort of Chinese ASD probands (Guo et al., 2017). Transmission and De Novo Association (TADA) analysis of a combined cohort consisting of 536 Chinese ASD probands and 1457 Chinese controls, as well as ASD probands and controls from the Simons Simplex Collection and the Autism Sequencing Consortium, in Guo et al., 2017 identified KRT26 as an ASD candidate gene with a PTADA of 0.005182.

Molecular Function

The protein encoded by this gene is a member of the keratin superfamily.

External Links

        

References

Type
Title
Type of Disorder
Associated Disorders
Author, Year
Primary
Excess of rare, inherited truncating mutations in autism.
ASD
Support
Integrating de novo and inherited variants in 42
ASD
Recent Recommendation
Targeted sequencing and functional analysis reveal brain-size-related genes and their networks in autism spectrum disorders.
ASD

Rare

Variant ID
Variant Type
Allele Change
Residue Change
Inheritance Pattern
Inheritance Association
Family Type
Author, Year
 GEN956R001 
 missense_variant 
 c.1352C>T 
 p.Ser451Phe 
 Familial 
 Paternal 
 Simplex 
 GEN956R002 
 missense_variant 
 c.1352C>T 
 p.Ser451Phe 
 Familial 
 Maternal 
 Simplex 
 GEN956R003 
 splice_site_variant 
 CTTTA>TTTTC 
 p.? 
 Familial 
 Maternal 
 Simplex 
 GEN956R004 
 splice_site_variant 
 A>T 
 p.? 
 Familial 
 Maternal 
 Simplex 
 GEN956R005 
 splice_site_variant 
 A>T 
 p.? 
 Familial 
 Maternal 
 Simplex 
 GEN956R006 
 splice_site_variant 
 A>T 
 p.? 
 Familial 
 Maternal 
 Simplex 
 GEN956R007 
 splice_site_variant 
 A>T 
 p.? 
 Familial 
 Paternal 
 Simplex 
 GEN956R008 
 splice_site_variant 
 c.1187+2T>A 
  
 Familial 
 Maternal 
 Simplex 
 GEN956R009 
 splice_site_variant 
 c.1187+2T>A 
  
 Familial 
 Paternal 
 Simplex 
 GEN956R010 
 stop_gained 
 c.1164C>A 
 p.Cys388Ter 
 Familial 
 Paternal 
 Simplex 
 GEN956R011 
 stop_gained 
 c.1078C>T 
 p.Arg360Ter 
 Familial 
 Paternal 
 Simplex 
 GEN956R012 
 frameshift_variant 
 c.1066del 
 p.Leu356CysfsTer21 
 Familial 
 Paternal 
 Simplex 
 GEN956R013 
 missense_variant 
 c.1024C>T 
 p.Leu342Phe 
 Familial 
 Paternal 
 Simplex 
 GEN956R014 
 missense_variant 
 C>G 
 p.Glu316Gln 
 Familial 
 Paternal 
 Simplex 
 GEN956R015 
 missense_variant 
 C>G 
 p.Glu316Gln 
 Familial 
 Maternal 
 Simplex 
 GEN956R016 
 missense_variant 
 C>G 
 p.Glu316Gln 
 Familial 
 Maternal 
 Simplex 
 GEN956R017 
 frameshift_variant 
 c.286del 
 p.Ser96ProfsTer9 
 Familial 
 Paternal 
 Simplex 
 GEN956R018 
 frameshift_variant 
 c.286del 
 p.Ser96ProfsTer9 
 Familial 
 Maternal 
 Simplex 
 GEN956R019 
 stop_gained 
 G>T 
 p.Ser37Ter 
 Familial 
 Paternal 
 Simplex 
 GEN956R020 
 stop_gained 
 c.110C>A 
 p.Ser37Ter 
 Familial 
 Maternal 
 Simplex 
 GEN956R021 
 stop_gained 
 c.110C>A 
 p.Ser37Ter 
 Familial 
 Maternal 
 Simplex 
 GEN956R022 
 initiator_codon_variant 
 c.2T>C 
 p.Met1? 
 Familial 
 Maternal 
 Simplex 
 GEN956R023 
 splice_site_variant 
 CTTTA>TTTTC 
 p.? 
 Familial 
 Maternal 
 Simplex 
 GEN956R024 
 splice_site_variant 
 c.1187+2T>A 
  
 Familial 
 Paternal 
 Simplex 
 GEN956R025 
 stop_gained 
 c.1164C>A 
 p.Cys388Ter 
 Familial 
 Paternal 
 Simplex 
 GEN956R026 
 missense_variant 
 c.949C>T 
 p.Leu317Phe 
 Familial 
 Paternal 
 Simplex 
 GEN956R027 
 missense_variant 
 c.946G>C 
 p.Glu316Gln 
 Familial 
 Paternal 
 Simplex 
 GEN956R028 
 missense_variant 
 c.946G>C 
 p.Glu316Gln 
 Familial 
 Paternal 
 Simplex 
 GEN956R029 
 missense_variant 
 c.946G>C 
 p.Glu316Gln 
 Familial 
 Maternal 
 Simplex 
 GEN956R030 
 missense_variant 
 c.488A>T 
 p.Asp163Val 
 Familial 
 Paternal 
 Simplex 
 GEN956R031 
 frameshift_variant 
 c.286del 
 p.Ser96ProfsTer9 
 Familial 
 Paternal 
 Simplex 
 GEN956R032 
 frameshift_variant 
 c.274_287del 
 p.Asp92LeufsTer27 
 Familial 
 Maternal 
 Simplex 
 GEN956R033 
 missense_variant 
 c.277C>T 
 p.Arg93Cys 
 Familial 
 Maternal 
 Simplex 
 GEN956R034 
 stop_gained 
 c.110C>A 
 p.Ser37Ter 
 Familial 
 Maternal 
 Simplex 
 GEN956R035 
 stop_gained 
 c.1060G>T 
 p.Glu354Ter 
 Familial 
  
  
 GEN956R036 
 missense_variant 
 c.277C>T 
 p.Arg93Cys 
 Familial 
  
  
 GEN956R037 
 stop_gained 
 c.43C>T 
 p.Arg15Ter 
 De novo 
  
  
 GEN956R038 
 frameshift_variant 
 c.920_921del 
 p.Lys307ThrfsTer21 
 Familial 
 Paternal 
 Multiplex 
 GEN956R039 
 stop_gained 
 c.43C>T 
 p.Arg15Ter 
 Familial 
 Maternal 
 Multiplex 
 GEN956R040 
 stop_gained 
 c.43C>T 
 p.Arg15Ter 
 Familial 
 Maternal 
 Multiplex 

Common

No Common Variants Available
Chromosome
CNV Locus
CNV Type
# of studies
Animal Model
17
Duplication
 1
 
17
Duplication
 1
 

No Animal Model Data Available

No PIN Data Available
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