HELP     Sign In
Search

Relevance to Autism

A rare deletion in the CAMTA1 gene has been identified with developmental delay (Mikhail et al., 2011).

Molecular Function

This protein is a transcriptional activator and may act as a tumor suppressor.

External Links

        

References

Type
Title
Type of Disorder
Associated Disorders
Author, Year
Primary
Clinically relevant single gene or intragenic deletions encompassing critical neurodevelopmental genes in patients with developmental delay, mental...
DD
ID, ADHD, PDD
Support
Intragenic CAMTA1 rearrangements cause non-progressive congenital ataxia with or without intellectual disability.
Non-progressive congenital ataxia (NPCA)
ID
Support
Non-coding de novo mutations in chromatin interactions are implicated in autism spectrum disorder
ASD
Support
Functional impact of global rare copy number variation in autism spectrum disorders.
ASD
Support
Whole genome sequencing and variant discovery in the ASPIRE autism spectrum disorder cohort.
ASD
Support
Cerebellar dysfunction with variable cognitive and
ASD or autistic features, ID
Support
Using medical exome sequencing to identify the causes of neurodevelopmental disorders: experience of two clinical units and 216 patients.
ASD
Support
Cerebellar dysfunction with variable cognitive and
Support
The genomic landscape of balanced cytogenetic abnormalities associated with human congenital anomalies.
DD, hypotonia, dysarthria
Support
Large-scale discovery of novel genetic causes of developmental disorders.
DD
Cognitive impairment
Support
Intragenic CAMTA1 deletions are associated with a spectrum of neurobehavioral phenotypes.
DD, ID, ADHD
Epilepsy
Support
Integrating de novo and inherited variants in 42
ASD

Rare

Variant ID
Variant Type
Allele Change
Residue Change
Inheritance Pattern
Inheritance Association
Family Type
Author, Year
 GEN291R001 
 copy_number_loss 
  
  
 De novo 
  
  
 GEN291R002 
 copy_number_gain 
  
  
 Familial 
 Maternal 
  
 GEN291R003 
 copy_number_loss 
  
  
 Familial 
 Maternal 
 Multi-generational 
 GEN291R004 
 copy_number_gain 
  
  
 Familial 
 Maternal 
 Multi-generational 
 GEN291R005 
 copy_number_loss 
  
  
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN291R006 
 copy_number_loss 
  
  
 Familial 
 Maternal 
 Multi-generational 
 GEN291R007 
 copy_number_loss 
  
  
 Unknown 
 Not paternal 
 Multi-generational 
 GEN291R008 
 copy_number_loss 
  
  
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN291R009 
 missense_variant 
 c.3403C>T 
 p.Arg1135Trp 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN291R010 
 translocation 
  
  
 Familial 
 Maternal 
 Multi-generational 
 GEN291R011 
 missense_variant 
 c.2863C>T 
 p.Arg955Trp 
 De novo 
  
  
 GEN291R012 
 missense_variant 
 c.3130A>G 
 p.Lys1044Glu 
 Unknown 
  
 Multiplex 
 GEN291R013a 
 missense_variant 
 c.1438A>G 
 p.Thr480Ala 
 Familial 
 Both parents 
 Simplex 
 GEN291R014 
 stop_gained 
 c.1828C>T 
 p.Gln610Ter 
 De novo 
  
  
 GEN291R015 
 missense_variant 
 c.1991C>T 
 p.Thr664Met 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN291R016 
 missense_variant 
 c.2961G>T 
 p.Glu987Asp 
 De novo 
  
  
 GEN291R017 
 synonymous_variant 
 c.3117C>T 
 p.Val1039%3D 
 De novo 
  
  
 GEN291R018 
 splice_region_variant 
 c.4990-5T>C 
  
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN291R019 
 missense_variant 
 c.299C>G 
 p.Thr100Arg 
 De novo 
  
  
 GEN291R020 
 missense_variant 
 c.1109C>T 
 p.Pro370Leu 
 De novo 
  
  
 GEN291R021 
 stop_gained 
 c.4231C>T 
 p.Arg1411Ter 
 Unknown 
  
  
 GEN291R022 
 missense_variant 
 c.4579G>T 
 p.Ala1527Ser 
 Unknown 
  
 Simplex 
 GEN291R023 
 initiator_codon_variant 
 c.1A>G 
 p.Met1? 
 Familial 
 Paternal 
 Multiplex 
  et al.  
 GEN291R024 
 stop_gained 
 c.208G>T 
 p.Glu70Ter 
 De novo 
  
 Simplex 
  et al.  
 GEN291R025 
 frameshift_variant 
 c.495dup 
 p.Tyr166LeufsTer114 
 De novo 
  
 Simplex 
  et al.  
 GEN291R026 
 stop_gained 
 c.766C>T 
 p.Gln256Ter 
 Familial 
 Paternal 
 Multiplex 
  et al.  
 GEN291R027 
 frameshift_variant 
 c.792del 
 p.Tyr267ThrfsTer93 
 De novo 
  
 Simplex 
  et al.  
 GEN291R028 
 frameshift_variant 
 c.1152dup 
 p.Thr385HisfsTer12 
 Unknown 
  
  
  et al.  
 GEN291R029 
 frameshift_variant 
 c.1780del 
 p.Asp594ThrfsTer42 
 De novo 
  
 Simplex 
  et al.  
 GEN291R030 
 stop_gained 
 c.1828C>T 
 p.Gln610Ter 
 De novo 
  
 Simplex 
  et al.  
 GEN291R031 
 stop_gained 
 c.2314C>T 
 p.Gln772Ter 
 Familial 
 Maternal 
  
  et al.  
 GEN291R032 
 frameshift_variant 
 c.2648del 
 p.Pro883GlnfsTer5 
 De novo 
  
 Simplex 
  et al.  
 GEN291R033 
 stop_gained 
 c.2685G>A 
 p.Trp895Ter 
 Unknown 
  
  
  et al.  
 GEN291R034 
 splice_site_variant 
 c.2689+1G>A 
  
 Familial 
 Paternal 
  
  et al.  
 GEN291R035 
 frameshift_variant 
 c.2871_2883del 
 p.Thr959ProfsTer31 
 Familial 
 Paternal 
  
  et al.  
 GEN291R036 
 frameshift_variant 
 c.4013_4014del 
 p.Glu1338GlyfsTer11 
 De novo 
  
 Simplex 
  et al.  
 GEN291R037 
 stop_gained 
 c.4759C>T 
 p.Gln1587Ter 
 De novo 
  
 Simplex 
  et al.  
 GEN291R038 
 copy_number_loss 
  
  
 Familial 
 Paternal 
  
  et al.  
 GEN291R039 
 copy_number_loss 
  
  
 De novo 
  
  
  et al.  
 GEN291R040 
 copy_number_loss 
  
  
 Unknown 
  
  
  et al.  
 GEN291R041 
 missense_variant 
 c.423G>C 
 p.Lys141Asn 
 De novo 
  
 Simplex 
  et al.  
 GEN291R042 
 missense_variant 
 c.495C>G 
 p.Cys165Trp 
 De novo 
  
 Simplex 
  et al.  
 GEN291R043 
 missense_variant 
 c.850C>T 
 p.Arg284Cys 
 De novo 
  
 Simplex 
  et al.  
 GEN291R044 
 missense_variant 
 c.1499G>C 
 p.Gly500Ala 
 Familial 
 Paternal 
  
  et al.  
 GEN291R045 
 missense_variant 
 c.4574A>G 
 p.Tyr1525Cys 
 De novo 
  
 Simplex 
  et al.  
 GEN291R046 
 missense_variant 
 c.2863C>T 
 p.Arg955Trp 
 De novo 
  
 Simplex 
  et al.  

Common

No Common Variants Available
Chromosome
CNV Locus
CNV Type
# of studies
Animal Model
1
Deletion
 9
 
1
Deletion
 1
 
1
Deletion-Duplication
 15
 
1
Duplication
 1
 
1
Duplication
 1
 
1
Deletion
 1
 
1
Deletion-Duplication
 2
 
1
Deletion-Duplication
 15
 
1
Deletion
 1
 
1
Deletion
 2
 
1
Deletion
 3
 
1
Deletion
 1
 
1
Duplication
 1
 
1
Deletion
 4
 
1
Deletion
 6
 
1
Deletion
 4
 

No Animal Model Data Available

No PIN Data Available
HELP
Copyright © 2017 MindSpec, Inc.