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Relevance to Autism

A total of three de novo loss-of-function (LoF) variants in the ANK2 gene have been identified in ASD probands from the Simons Simplex Collection (PMIDs 22542183, 24267886, 25363768), while a fourth de novo LoF in this gene was identified in an ASD proband from the Autism Sequencing Consortium in De Rubeis et al., 2014 (PMID 25363760). Analysis of rare coding variation in 3,871 ASD cases and 9,937 ancestry-matched or paternal controls from the Autism Sequencing Consortium (ASC) in De Rubeis et al., 2014 identified ANK2 as a gene meeting high statistical significance with a FDR 0.01, meaning that this gene had a 99% chance of being a true autism gene (PMID 25363760). This gene was identified in Iossifov et al. 2015 as a strong candidate to be an ASD risk gene based on a combination of de novo mutational evidence and the absence or very low frequency of mutations in controls (PMID 26401017). A two-stage analysis of rare de novo and inherited coding variants in 42,607 ASD cases, including 35,130 new cases from the SPARK cohort, in Zhou et al., 2022 identified ANK2 as a gene reaching exome-wide significance (P < 2.5E-06).

Molecular Function

This gene encodes a member of the ankyrin family of proteins that link the integral membrane proteins to the underlying spectrin-actin cytoskeleton. This gene is associated with Long QT syndrome 4 (LQT4) [MIM:600919], a heart disorder characterized by a prolonged QT interval on the ECG and polymorphic ventricular arrhythmias.

External Links

        

References

Type
Title
Type of Disorder
Associated Disorders
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De novo gene disruptions in children on the autistic spectrum.
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Variant ID
Variant Type
Allele Change
Residue Change
Inheritance Pattern
Inheritance Association
Family Type
Author, Year
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 De novo 
  
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 De novo 
  
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 Maternal 
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 Maternal 
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 Unknown 
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 Unknown 
  
 Unknown 
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 Unknown 
  
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 Unknown 
  
 Unknown 
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 Unknown 
  
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 Unknown 
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 Unknown 
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 Unknown 
  
 Unknown 
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 Unknown 
  
 Unknown 
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 Unknown 
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 Unknown 
  
 Unknown 
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 Unknown 
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 De novo 
  
 Multiplex 
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 Maternal 
  
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 Unknown 
 Not maternal 
  
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 Not maternal 
  
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 De novo 
  
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 Multiplex 
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 De novo 
  
  
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 De novo 
  
 Simplex 
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 Familial 
  
 Simplex 
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 Familial 
  
 Simplex 
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 missense_variant 
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 Familial 
  
 Simplex 
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 missense_variant 
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 Familial 
  
 Simplex 
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 stop_gained 
 c.3007C>T 
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 De novo 
  
 Simplex 
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 Familial 
 Maternal 
 Simplex 
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 missense_variant 
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 Familial 
 Maternal 
 Simplex 
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 missense_variant 
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 Familial 
 Paternal 
 Simplex 
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 missense_variant 
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 Familial 
 Maternal 
 Simplex 
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 c.3339C>T 
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 De novo 
  
  
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 De novo 
  
 Simplex 
 GEN587R078 
 synonymous_variant 
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 De novo 
  
 Simplex 
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 De novo 
  
 Simplex 
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 De novo 
  
  
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 De novo 
  
  
 GEN587R082 
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 c.4400-1628_4400-1627dup 
  
 De novo 
  
  
 GEN587R083 
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 Familial 
 Maternal 
  
 GEN587R084 
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 Familial 
 Paternal 
 Simplex 
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 stop_gained 
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 Familial 
 Paternal 
  
 GEN587R086 
 frameshift_variant 
 c.4399+4052del 
  
 Unknown 
  
  
 GEN587R087 
 frameshift_variant 
 c.11241_11245del 
 p.Glu3747AspfsTer14 
 Unknown 
  
  
 GEN587R088 
 stop_gained 
 c.4252C>T 
 p.Arg1418Ter 
 Unknown 
  
  
 GEN587R089 
 stop_gained 
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 Unknown 
  
  
 GEN587R090 
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 Maternal 
  
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 missense_variant 
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 Maternal 
  
 GEN587R092 
 missense_variant 
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 p.Gly740Arg 
 Familial 
 Maternal 
  
 GEN587R093 
 missense_variant 
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 Familial 
 Maternal 
  
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 missense_variant 
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 Familial 
 Maternal 
  
 GEN587R095 
 missense_variant 
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 Familial 
 Maternal 
  
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 Familial 
 Maternal 
  
 GEN587R097 
 missense_variant 
 c.2000T>A 
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 Familial 
 Maternal 
  
 GEN587R098 
 missense_variant 
 c.2000T>A 
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 Familial 
 Paternal 
  
 GEN587R099 
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 missense_variant 
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 Familial 
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 missense_variant 
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 Familial 
 Paternal 
  
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 Familial 
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 Familial 
 Paternal 
  
 GEN587R108 
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 GEN587R109 
 missense_variant 
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 Unknown 
  
  
 GEN587R110 
 missense_variant 
 c.1247T>G 
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 Unknown 
  
 Simplex 
 GEN587R111 
 missense_variant 
 c.1448C>T 
 p.Ala483Val 
 Unknown 
  
  
 GEN587R112 
 missense_variant 
 c.3163G>A 
 p.Glu1055Lys 
 Unknown 
  
  
 GEN587R113 
 missense_variant 
 c.3550C>A 
 p.Arg1184Ser 
 Unknown 
  
  
 GEN587R114 
 missense_variant 
 c.3914C>T 
 p.Ala1305Val 
 Unknown 
  
  
 GEN587R115 
 missense_variant 
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 Unknown 
  
  
 GEN587R116 
 missense_variant 
 c.5543G>C 
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 Unknown 
  
  
 GEN587R117 
 missense_variant 
 c.4399+4175C>T 
  
 Unknown 
  
  
 GEN587R118 
 missense_variant 
 c.4399+4175C>T 
  
 Unknown 
  
  
 GEN587R119 
 missense_variant 
 c.4400-3311C>T 
  
 Unknown 
  
  
 GEN587R120 
 missense_variant 
 c.8894C>T 
 p.Thr2965Ile 
 Unknown 
  
  
 GEN587R121 
 missense_variant 
 c.679G>A 
 p.Val227Met 
 Unknown 
  
 Simplex 
 GEN587R122 
 missense_variant 
 c.3265C>T 
 p.Arg1089Cys 
 Unknown 
  
  
 GEN587R123 
 missense_variant 
 c.4400-3033C>T 
  
 Unknown 
  
  
 GEN587R124 
 missense_variant 
 c.2203G>A 
 p.Ala735Thr 
 Unknown 
  
  
 GEN587R125 
 missense_variant 
 c.4426G>A 
 p.Glu1476Lys 
 Unknown 
  
  
 GEN587R126 
 missense_variant 
 c.5434C>T 
 p.Arg1812Trp 
 Unknown 
  
  
 GEN587R127 
 missense_variant 
 c.4400-2349G>A 
  
 Unknown 
  
  
 GEN587R128 
 missense_variant 
 c.1268C>T 
 p.Ser423Leu 
 Unknown 
  
  
 GEN587R129 
 missense_variant 
 c.257G>A 
 p.Arg86Lys 
 Unknown 
  
  
 GEN587R130 
 missense_variant 
 c.1514C>T 
 p.Ala505Val 
 Unknown 
  
  
 GEN587R131 
 missense_variant 
 c.1871C>T 
 p.Ala624Val 
 Unknown 
  
  
 GEN587R132 
 missense_variant 
 c.2959C>T 
 p.Arg987Trp 
 Unknown 
  
  
 GEN587R133 
 missense_variant 
 c.4180T>A 
 p.Phe1394Ile 
 Unknown 
  
  
 GEN587R134 
 missense_variant 
 c.10798C>G 
 p.Gln3600Glu 
 Unknown 
  
  
 GEN587R135 
 missense_variant 
 c.5401G>A 
 p.Val1801Met 
 Unknown 
  
  
 GEN587R136 
 missense_variant 
 c.3886C>G 
 p.Arg1296Gly 
 Unknown 
  
  
 GEN587R137 
 missense_variant 
 c.3065G>A 
 XP_005262998.1:p.Arg1022Gln 
 Unknown 
 Not paternal 
  
 GEN587R138 
 frameshift_variant 
 c.4400-3319del 
  
 Familial 
 Maternal 
  
 GEN587R139 
 frameshift_variant 
 c.5683del 
 p.Ser1895LeufsTer99 
 Unknown 
  
  
 GEN587R140 
 stop_gained 
 c.4400-4143C>T 
  
 Unknown 
  
  
 GEN587R141 
 frameshift_variant 
 c.2121del 
 p.Val708Ter 
 Unknown 
  
  
 GEN587R142 
 frameshift_variant 
 c.10463del 
 p.Leu3488Ter 
 Unknown 
  
  
 GEN587R143 
 frameshift_variant 
 c.11003_11006del 
 p.Glu3668GlyfsTer106 
 Unknown 
  
  
 GEN587R144 
 stop_gained 
 c.2941C>T 
 p.Arg981Ter 
 Unknown 
  
  
 GEN587R145 
 stop_gained 
 c.4400-4494G>T 
  
 Unknown 
  
  
 GEN587R146 
 stop_gained 
 c.*35C>T 
  
 Unknown 
  
  
 GEN587R147 
 missense_variant 
 c.4399+4113C>T 
  
 Unknown 
  
  
 GEN587R148 
 missense_variant 
 c.4399+4113C>T 
  
 Unknown 
  
  
 GEN587R149 
 missense_variant 
 c.4247G>T 
 p.Cys1416Phe 
 Unknown 
  
  
 GEN587R150 
 missense_variant 
 c.1991C>T 
 p.Thr664Ile 
 Unknown 
  
  
 GEN587R151 
 missense_variant 
 c.4400-3032G>A 
  
 Unknown 
  
  
 GEN587R152 
 missense_variant 
 c.4625G>A 
 p.Cys1542Tyr 
 Unknown 
  
  
 GEN587R153 
 missense_variant 
 c.5543G>C 
 p.Arg1848Pro 
 Unknown 
  
  
 GEN587R154 
 missense_variant 
 c.1943C>T 
 p.Ala648Val 
 Unknown 
  
  
 GEN587R155 
 missense_variant 
 c.2006C>T 
 p.Ala669Val 
 Unknown 
  
  
 GEN587R156 
 missense_variant 
 c.2773C>T 
 p.Arg925Cys 
 Unknown 
  
  
 GEN587R157 
 missense_variant 
 c.1552C>T 
 p.Arg518Trp 
 Unknown 
  
  
 GEN587R158 
 missense_variant 
 c.2918G>A 
 p.Arg973Gln 
 Unknown 
  
  
 GEN587R159 
 missense_variant 
 c.3545G>A 
 p.Arg1182Gln 
 Unknown 
  
  
 GEN587R160 
 missense_variant 
 c.1774C>A 
 p.Leu592Met 
 Unknown 
  
  
 GEN587R161 
 missense_variant 
 c.3083G>A 
 p.Ser1028Asn 
 Unknown 
  
  
 GEN587R162 
 missense_variant 
 c.2203G>A 
 p.Ala735Thr 
 Unknown 
  
  
 GEN587R163 
 missense_variant 
 c.4112C>T 
 XP_005262998.1:p.Pro1371Leu 
 Unknown 
  
  
 GEN587R164 
 missense_variant 
 c.3989C>T 
 p.Pro1330Leu 
 Unknown 
  
  
 GEN587R165 
 missense_variant 
 c.3989C>T 
 p.Pro1330Leu 
 Unknown 
  
  
 GEN587R166 
 missense_variant 
 c.4426G>A 
 p.Glu1476Lys 
 Unknown 
  
  
 GEN587R167 
 missense_variant 
 c.899G>A 
 p.Arg300Gln 
 Unknown 
  
  
 GEN587R168 
 missense_variant 
 c.11800G>A 
 p.Asp3934Asn 
 Unknown 
  
  
 GEN587R169 
 missense_variant 
 c.1297G>A 
 p.Gly433Arg 
 Unknown 
  
  
 GEN587R170 
 missense_variant 
 c.1297G>A 
 p.Gly433Arg 
 Unknown 
  
  
 GEN587R171 
 missense_variant 
 c.2942G>A 
 p.Arg981Gln 
 Unknown 
  
  
 GEN587R172 
 missense_variant 
 c.2942G>A 
 p.Arg981Gln 
 Unknown 
  
  
 GEN587R173 
 missense_variant 
 c.3005G>A 
 p.Arg1002His 
 Unknown 
  
  
 GEN587R174 
 missense_variant 
 c.3005G>A 
 p.Arg1002His 
 Unknown 
  
  
 GEN587R175 
 missense_variant 
 c.2773C>T 
 p.Arg925Cys 
 Unknown 
  
  
 GEN587R176 
 splice_site_variant 
 c.2799-1G>A 
  
 Unknown 
  
  
 GEN587R177 
 stop_gained 
 c.6055C>T 
 p.Gln2019Ter 
 De novo 
  
  
 GEN587R178 
 splice_region_variant 
 c.1288-5C>T 
  
 De novo 
  
  
 GEN587R179 
 missense_variant 
 c.1517G>A 
 p.Arg506His 
 De novo 
  
  
 GEN587R180 
 frameshift_variant 
 c.4038del 
 p.Trp1347GlyfsTer2 
 De novo 
  
  
 GEN587R181 
 splice_region_variant 
 c.4240G>A 
 p.Glu1414Lys 
 De novo 
  
  
 GEN587R182 
 missense_variant 
 c.11266A>T 
 p.Lys3756Ter 
 De novo 
  
  
 GEN587R183 
 splice_site_variant 
 c.222+1G>T 
  
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN587R184 
 frameshift_variant 
 c.3632_3633del 
 p.Ile1211ArgfsTer40 
 De novo 
  
  
 GEN587R185 
 splice_site_variant 
 c.2797-1G>A 
  
 De novo 
  
  
 GEN587R186 
 stop_gained 
 c.922C>T 
 p.Gln308Ter 
 De novo 
  
  
 GEN587R187 
 copy_number_loss 
  
  
 Unknown 
  
  
 GEN587R188 
 splice_site_variant 
 c.2179-1G>A 
  
 De novo 
  
  
 GEN587R189 
 stop_gained 
 c.3019C>T 
 p.Arg1007Ter 
 De novo 
  
  
 GEN587R190 
 copy_number_loss 
  
  
 De novo 
  
  
 GEN587R191 
 frameshift_variant 
 c.1046_1047del 
 p.His349ArgfsTer91 
 De novo 
  
  
 GEN587R192 
 frameshift_variant 
 c.4400-4986del 
  
 De novo 
  
  
 GEN587R193 
 splice_site_variant 
 c.1288-1G>A 
  
 De novo 
  
  
 GEN587R194 
 stop_gained 
 c.10768G>T 
 p.Glu3590Ter 
 De novo 
  
  
 GEN587R195 
 stop_gained 
 c.862C>T 
 p.His288Tyr 
 De novo 
  
  
 GEN587R196 
 splice_site_variant 
 c.3934_3937del 
 p.Ile1312SerfsTer10 
 De novo 
  
  
 GEN587R197 
 inframe_deletion 
 c.4123_4125del 
 p.Ala1375del 
 De novo 
  
 Simplex 
 GEN587R198 
 stop_gained 
 c.5479C>T 
 p.Gln1827Ter 
 Familial 
 Paternal 
 Multiplex 
 GEN587R199 
 missense_variant 
 c.6311G>C 
 p.Ser2104Thr 
 Familial 
 Maternal 
 Multiplex 
 GEN587R200 
 synonymous_variant 
 c.4371G>A 
 p.Lys1457= 
 De novo 
  
  
 GEN587R201a 
 copy_number_gain 
  
  
 Familial 
 Maternal 
  
 GEN587R201b 
 copy_number_gain 
  
  
 Familial 
 Maternal 
  
 GEN587R202a 
 copy_number_gain 
  
  
 Familial 
 Maternal 
  
 GEN587R202b 
 copy_number_gain 
  
  
 Familial 
 Maternal 
  
 GEN587R203 
 missense_variant 
 c.1967T>C 
 p.Met656Thr 
 Unknown 
  
  
Chromosome
CNV Locus
CNV Type
# of studies
Animal Model
4
Duplication
 1
 
4
Duplication
 1
 
4
Deletion-Duplication
 19
 
4
Duplication
 8
 
4
Deletion-Duplication
 12
 

Model Summary

Ank2 null mice exhibit hypoplasia of the corpus callosum, pyramidal tracts and degeneration of the optic nerve.

References

Type
Title
Author, Year
Additional
ANK2 autism mutation targeting giant ankyrin-B promotes axon branching and ectopic connectivity.
Additional
Primary
Nervous system defects of AnkyrinB (-/-) mice suggest functional overlap between the cell adhesion molecule L1 and 440-kD AnkyrinB in premyelinated...
Model Type: Genetic
Model Genotype: Homozygous
Mutation: Homozygous ABe22*/* mice, models for human R895* [c.2683C > T], R990* [c.2968C > T] de novo nonsense mutations associated with ASD, have a stop codon inserted into exon 22 producing nonsense-mediated decay in both the 220-kDa and giant ankB polypeptides.
Allele Type: Partial knockout
Strain of Origin: 129SVJ
Genetic Background: C57Bl/6
ES Cell Line:
Mutant ES Cell Line:
Model Source:
Category
Entity
Quantity
Experimental Paradigm
Age at Testing
General locomotor activity1
Decreased
 General observations
 P14
Mortality/lethality2
Increased
 Kaplan-meier survival curve
 0-7 months
Mortality/lethality1
Increased
 General observations
 P0-p20
Protein modification process1
Decreased
 Western blot
 P7
Protein modification process1
 No change
 Western blot
 P7
Protein modification process1
 No change
 Western blot
 P7
Brain anatomy1
 No change
 NA
 P0-p3
 Not Reported: Circadian sleep/wake cycle, Communications, Emotion, Immune response, Learning & memory, Maternal behavior, Neurophysiology, Physiological parameters, Repetitive behavior, Seizure, Sensory, Social behavior


Interactor Symbol Interactor Name Interactor Organism Entrez ID Uniprot ID Interaction Type Evidence Reference
ACOT7 acyl-CoA thioesterase 7 11332 O00154 IP; LC-MS/MS; IP/WB
Li J , et al. 2016
C14ORF104 Protein kintoun 55172 Q9NVR5-2 IP; LC-MS/MS
Huttlin EL , et al. 2015
CCT2 chaperonin containing TCP1, subunit 2 (beta) 10576 P78371 IP; LC-MS/MS
Li J , et al. 2016
CHL1 cell adhesion molecule with homology to L1CAM (close homolog of L1) 10752 O00533 IP; LC-MS/MS
Huttlin EL , et al. 2015
CRNKL1 crooked neck pre-mRNA splicing factor-like 1 (Drosophila) 51340 Q9BZJ0 IP; LC-MS/MS
Li J , et al. 2016
DGUOK deoxyguanosine kinase 1716 E5KSL5 IP; LC-MS/MS
Huttlin EL , et al. 2015
DMD dystrophin 1756 P11532 in vitro binding assay
Ayalon G , et al. 2008
DNAJB1 DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 1 3337 P25685 GST; Y2H; IP/WB
Mohler PJ , et al. 2004
EPB42 erythrocyte membrane protein band 4.2 2038 P16452 Reconstituted complex
Korsgren C and Cohen CM 1988
FARP1 FERM, RhoGEF (ARHGEF) and pleckstrin domain protein 1 (chondrocyte-derived) 10160 Q9Y4F1 IP; LC-MS/MS
Li J , et al. 2016
FMR1 fragile X mental retardation 1 14265 P35922 HITS-CLIP
Darnell JC , et al. 2011
FTSJ3 FtsJ homolog 3 (E. coli) 117246 Q8IY81 IP; LC-MS/MS
Li J , et al. 2016
HAX1 HCLS1 associated protein X-1 10456 O00165 IP; LC-MS/MS
Huttlin EL , et al. 2015
HIF1AN hypoxia inducible factor 1, alpha subunit inhibitor 55662 Q9NWT6 IP; LC-MS/MS
Huttlin EL , et al. 2015
IP3R-3 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor, type 3 25679 Q63269 IP/WB
Hayashi T and Su TP 2001
KIAA0368 KIAA0368 23392 J3KN16 Y2H; LC-MS/MS
Gorbea C , et al. 2010
L1CAM L1 cell adhesion molecule 50687 Q05695 IP/WB
Hayashi T and Su TP 2001
MAPK8IP1 mitogen-activated protein kinase 8 interacting protein 1 9479 Q6NUQ9 IP; LC-MS/MS
Huttlin EL , et al. 2015
MYO1D myosin ID 4642 O94832 IP; LC-MS/MS
Li J , et al. 2016
NDEL1 nudE nuclear distribution E homolog (A. nidulans)-like 1 81565 Q9GZM8 Y2H
Camargo LM , et al. 2006
NFASC neurofascin 116690 P97685 IP/WB
Davis JQ and Bennett V 1994
NRCAM neuronal cell adhesion molecule 497815 Q6PW34 IP/WB
Davis JQ and Bennett V 1994
NUFIP1 Nuclear FMRP Interacting Protein 1 26747 Q9UHK0 IP; LC-MS/MS
Huttlin EL , et al. 2015
OBSCN obscurin, cytoskeletal calmodulin and titin-interacting RhoGEF 84033 Q5VST9 GST; IP/WB
Bagnato P , et al. 2003
PALM2 paralemmin 2 114299 Q8IXS6 IP; LC-MS/MS
Huttlin EL , et al. 2015
RAPGEF5 Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 5 9771 A8MQ07 IP; LC-MS/MS
Huttlin EL , et al. 2015
SIGMAR1 sigma non-opioid intracellular receptor 1 29336 Q9R0C9 IP/WB
Hayashi T and Su TP 2001
SLC8A1 solute carrier family 8 (sodium/calcium exchanger), member 1 29715 Q01728 IP/WB
Lencesova L , et al. 2003
SNCA synuclein, alpha (non A4 component of amyloid precursor) 6622 P37840 LC-MS/MS
McFarland MA , et al. 2008
SPTAN1 spectrin, alpha, non-erythrocytic 1 64159 P16086 IP/WB
Lencesova L , et al. 2003
SPTB spectrin, beta, erythrocytic 314251 Q6XDA0 IP/WB
Lencesova L , et al. 2003
SPTBN1 spectrin, beta, non-erythrocytic 1 6711 Q01082 Y2H; IP/WB
Mohler PJ , et al. 2004
TAF9 TAF9 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 32kDa 6880 Q16594 Y2H; IP/WB
Miyamoto-Sato E , et al. 2010
TNIK TRAF2 and NCK interacting kinase 23043 Q9UKE5 Y2H
Camargo LM , et al. 2006
TP53 tumor protein p53 7157 P04637 Y2H; IP/WB
Miyamoto-Sato E , et al. 2010
UBC ubiquitin C 7316 P63279 LC-MS/MS
Danielsen JM , et al. 2010

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